Надо ли заливать масло в новый фильтр АКПП Киа Сид?

Это не столь важно. Главное после окончательной сборки, залить нужное количество жидкости. Так как проверяется уровень на разогретой АКПП, при работающем моторе, то там фильтр уже точно будет заполнен.

Коробки есть различной конструкции, некоторые без щупов, при замене сколько слил, столько и надо залить, вот руководства и перестраховываются пишут о заполнении фильтра.

На вашей же коробке есть щуп (или нет)?

Полагаю речь идет про 4 ст. акпп, на ней есть щуп (на 6 ст. акпп нет щупа и фильтр ее, если я не ошибаюсь, меняется только при ремонте акпп, т.е. нужно половинить акпп), в фильтр акпп не нужно заливать масло, он «проходной» (с него все вытечет). Обратите внимание, когда снимете фильтр акпп, то вытечет некоторое количество жидкости, не облейтесь.

Масло примерно заливаете столько же, сколько и вытекло, НО потом обязательно проверить уровень щупом и при необходимости долить масло. Масло лучше заливать Mitsubishi Diamond SP III. Для частичной замены требуется примерно 4-5 литров масла (если со снятием поддона), если вы будете проводить две частичные замены через небольшой интервал, то фильтр акпп лучше заменить при второй замене масла.

Вам пригодится статья по замене масла в акпп.