Можно ли отключить чип в ключе полностью от системы автомобиля?

Можно, есть фигня от производителя, можно попытаться просто сразу обойти иммобилайзер, зависимо как на это отреагируют мозги.

Нужно выяснить связан ли мозг с иммобилайзером, или он просто разрывает замыкает эл.цепь, и поглядеть что иммобилайзер блокирует — стартер, бензонасос, зажигание.

Существует такая хрень, называется обходчик иммо. Поинтересуйтесь на сайте изготовителя сигнализации.