Может ли перестать заводиться дизель из-за топливного фильтра?

Ну а почему нет? Это как раз наиболее вероятная причина — недостаток поступления топлива.

Так же может быть вода попала в топливо. Или отказал ДПКВ. Или отказал ТНВД.

Проверяйте наличие топлива после ТНВД и давление, если соляра подаётся.

Педаль газа случаем не электронная?

А температура какая на улице и какое топливо залито (зимнее)? Вполне может быть не качественное топливо и оно замерзло, образовался парафин, начните с проверки топливного фильтра. Еще может быть воздух в топливной системе (например до ТНВД).

Температура воздуха +12. Снял топливный фильтр-как новенький, чистый. Прокачал вручную, воздуха нет. Может что-то с сигнализацией? На панели приборов все лампочки работают как положено. У меня это уже 19-я машина, но дизель впервые. Всегда сам ремонтировал машины, а сейчас чувствую себя круглым бараном.