Почему VIN код в ПТС и на кузове автомобиля различаются?

Обычно если два разных вин номера, то один российский, второй страны изготовления. Напишите оба вин номера. 

VIN-номер в ПТС должен совпадать с  VIN-номером на кузове автомобиля. Если имеется различие, то вам авто не зарегистрируют в МРЭО (в ГАИ). Если вы регистрировали всё-таки в МРЭО, то вам допустили ошибку (надо было сразу проверять при получении документов). Правильная информация, конечно же на кузове (если конечно автомобиль не «конструктор» и номера не перебиты в какой-то момент).