Из-за чего пропадает искра на ВАЗ 21099?

Разъёмы осмотрите. Коммутатора и датчика Холла. Подгоревших и проваленных клемм не должно быть.

А потом нормально заводится и едет, или тоже на 20 минут хватает? Катушка и сам коммутатор при этом не перегреты?

Вы считаете что я не внимательно прочитал вопрос, что вы его повторяете. Про новые клеммы, коммутатор и датчик можно было сразу написать, вопрос в том когда вы их поменяли, до появления дефекта или после. И я вам задал вопросы которые могли бы помочь составить общую картину проявления дефекта. И проверьте наличие питания на коммутатор, когда искра пропадает. Возможно просто контакт на предохранителе греется и питание пропадает.

На выводе Б катушки(сине-красный провод) проверяйте наличие напряжения +12в, она там появляется при включении зажигания. Естественно когда искра пропадает.

Николаевич же написал, что там нет предохранителя в этой цепи. Вы упорно не хотите прислушаться и проверить о чем вам пишут, я уж не знаю как вам еще помочь.

Все ваши предохранители находятся в одном месте. Поиск ведется с конца, а не абы откуда. Нет искры, проверяем напряжение на катушке, оно же идет на коммутатор. Напряжение есть, смотрим есть ли сигнал с датчика, есть, смотрим сигнал на катушке, и тд и тп, а не как-то иначе.

Какой именно? Если датчик Холла, так он под крышкой трамблера, на него провода с коммутатора идут.