Не работает вентилятор радиатора при включении кондиционера

Даже если поменять сальник, все равно хладоген будет нагреваться больше нормы. При включении кондера, включаться должен и компессор и оба вентилятора. Нужно найти причину не включения второго вентилятора. И сальник какое-то время менять не понадобится (он пропускает от того, что греется фреон больше нормы), возможно и хладогена в нем больше нормы, поэтому гонит.

У кондера независимо (климат или просто кондер), стоит свой блок управления.  Так-как у вас один вентилятор, получается-1 положение и 2 интенсивное, при большем нагреве жидкости, это режимы вентилятора на охлаждение охлаждающей жидкости двигателя, а третий управляется через реле от блока кондера.

Управление всегда минусовое, найдите реле кондера и проверьте на его управление плюсовое питание (должно быть постоянным), минусовое-при включении от ЭБУ кондера.

Cначал проверить предохранители, затем реле на включение вентилятора, у вас на радиаторе два или один вентилятор? Основной включается при высокой температуре ОЖ? Или он один на все? Вы не написали, у вас климат или просто кондер. Включение кнопкой или выставляется температура требуемая для водителя. Потому что системы по разному работают, сам компрессор включается? Если не включается компрессор, то и вентилятор не включится. Если наружная температура ниже запрашиваемой, кондер или климат не включится.

Массу питания вентилятора проверь для начала, а потом хладагенты, реле.... 

При включении кондиционера вентилятор должен включатся сразу же или с задержкой (примерно одна минута). На Шкода Фабия первого поколения вентилятор включается на основе показаний датчика давления фреона. Если фреон горячий, то значит, давление большое и вентилятор включается сразу.  Также обратная ситуация, если фреон холодный, то давление нарастает постепенно и вентилятор включается с небольшой задержкой (около одной минуты).

Если вентилятор не срабатывает, то для начала сделайте диагностику и как правило, уже можно выяснить где искать проблему. Если нет возможности сделать диагностику, то нужно проверить силовой предохранитель F68 (25А) в салоне. Он отвечает за цепь, идущую к вентилятору. 

Далее нужно отсоединить фишку питания вентилятора и от аккумулятора напрямую подать 12В. Если вентилятор не срабатывает, то его нужно заменить. Обратите внимание на распиновку фишки, чтобы все правильно подключить и не спалить вентилятор!

После проверки предохранителя и самого вентилятора нужно проверить на работоспособность блок управления скоростями вентилятора. Нужно прозвонить оба реле скоростей, согласно ниже представленной схеме.

Нужно подать 12 вольт на контакты 86а и 86b (второе реле) и по очереди на корпус K1 и K2 (второе реле). Если реле не срабатывают, то блок управления вентилятора нужно менять. Приобрести его можно по артикулу 1J0919506M. 

Также нужно проверить термодатчик. Для проверки установите перемычку в разъем датчика между контактами 1 и 2 (это будет первая скорость). Если после установки перемычки реле сработало и вентилятор включился, датчик под замену.

Если после вышеперечисленных проверок не удалось восстановить работу вентилятора, то наверняка проблема в обрыве проводки. Проверяйте косу до вентилятора, датчика, реле, а также от блока предохранителей.