Сбросятся ли настройки сигнализации при снятии аккумулятора?

Про сигнализацию можете не волноваться.
Там только при подсоединении аккумулятора дверь держать открытой, чтобы не заблокировались двери. Или сразу после подсоединения аккумулятора, моргнут фары, и сразу открыть-закрыть дверь, после этого действия блокировки не произойдёт.

А вот автомагнитола не будет работать, после отключения аккумулятора и потом при подключении его, пока вы не введёте 4-значный идентификационный номер.
Если не знаете этого кода, тогда и нельзя отключать питание автомагнитолы.