Двигатель работает с перебоями на ВАЗ 2104

Компрессию померить, может клапан прогорел. Вам бы в описание добавить так постоянно работает или при определенных температурах? Может и свеча, а может люфты в приводе трамблера.

Почистить или заменить контакты, проверить конденсатор, проверить или заменить свечи, провода, катушку, бегунок, крышку.

Да, и напряжение замерить, может перезаряд идёт.

Если снаружи всё перепробовали — остаётся проверять внутри. Снять клапанную крышку и проверить совпадение меток. Возможно цепь растянулась очень, метки разбежались — отсюда неровная работа мотора, а если натяжитель цепи не справляется, в смысле не натягивает уже цепь, как положено, то возможен вариант перескакивания цепи на зуб или более.

Опять же и компрессию надо проверить, при большом разбеге между цилиндрами будет неровная работа двигателя, ну и мощность упадёт.