Иногда глохнет на холостых ВАЗ 2109

Для начала помыть дроссельный узел, регулятор холостого хода.

Причины могут быть такие:  

 — неисправен  ЭМК (электромагнитный клапан) холостого хода  или на него не поступает напряжение  

 — не настроен холостой ход винтом количества    

 — высокий уровень топлива в поплавковой камере, на холостых оборотах происходит перелив, сильное обогащение и мотор глохнет  (если устанавливали уровень по одной из книжек руководства ВАЗ 2108/09/099, то они все врут о настройке уровня топлива в карбюраторе) 

  — бензонасос недокачивает топливо на холостых оборотах (причина: либо клапана насоса изношены либо регулировать шток надо — производительность  низкая на холостых).    

Ещё может из-за низкосортного бензина глохнуть, но это тогда и плохо бы запускался мотор.  

И если «троит», тоже может из-за этого плохая тяга и глохнет. В этом случае, для начала установить новые свечи зажигания.

Про настройку холостого хода можно почитать Здесь...  или   Тут ...

Топливо в поплавковой камере вы правильно замерили 25мм. (Во многих инструкциях пишут про перевернуть верхнюю часть карбюратора, от поверхности прокладки до поплавков 1мм  — это враньё, так не надо. На самом деле там до поплавков должно быть 7-8мм. Я на «девятке» делал даже и 10мм — отлично бегала машинка, не каждая иномарка могла обойти).   

Если вы в бензонасосе уверены, то хорошо.   Но… «Качает как новый...» — это вы если проверили вручную, то это одно, а во время работы двигателя он может и не так активно работать, если не настроен его привод. На всякий случай дам ссылку про его настройку:  Регулировка привода бензонасоса...

Про бензин и про свечи — понял вашу информацию.  Надеюсь что и калильное число свечей тоже выбрали верно.  На всякий случай дам ссылку про свечи:  Вот ...  и здесь:     Выбор свечей зажигания…

Что холостой ход теряется, это было ясно сразу в самом вопросе.   

А вот про ЭМК (электромагнитный клапан), что-то не совсем понятна ваша последняя информация.  Странный какой-то щелчок при перегазовке. Вы уверены, что именно  от ЭМК, этот щелчок?  

Работа этого клапана заключается в открытии и закрытии канала холостого хода в карбюраторе. Когда включаете зажигание, тогда сразу на ЭМК подаётся напряжение, он открывает канал холостого хода, вот в этот момент и щелчок. Во время работы двигателя он открыт постоянно и не должно быть щелчков.   Когда выключите зажигание, подача напряжения прекратится на клапан, он перекрывает канал холостого хода и мотор сразу глохнет.  

И ещё, если у вас стоит система ЭПХХ, то отключите эту дополнительную «роскошь». От неё кроме лишней головной боли, нет никакого толку (испытано практически. и не только мною).