Как можно убрать микротрещины в головке?

Нельзя. Ни как!

Если трещина выходит наружу где нет никакого крепежа и шов ничему не помешает, тогда можно попробовать заварить сваркой в аргоновой среде. Но опять же, смотря откуда идёт трещина, если системы охлаждения или масла, то можно пробовать заварить, а если она в цилиндре, то без вариантов — только замена головки. Но самый лучший вариант, при любой трещине — замена ГБЦ.

Лучшее решение замена. Не мало раз встречал гбц после сварки с трещиной в том же месте. ГБЦ и новые не любят перегрева, а со швом тем более.