Могло ли погнуть клапана Мазда 929?

Могло, если ремень меняли после обрыва строго — точно погнуло.

Могли ошибиться при установке нового. После установки нового первые ДВА оборота двигателя нужно сделать вручную и не спешно, для проверки 

 Мотор FE 2.0 — клапана не гнёт при обрыве ремня ГРМ (не должно гнуть). 

Эти моторы были 8-ми клапанные с одним распредвалом. и были 12-ти клапанные с двумя распредвалами. Если 2-ух вальный, то там уже вопрос, насчёт загибания клапанов, как говорится 50 на 50, может не загнуть, а может и загнуть, всё зависит от условий (какие обороты были в момент обрыва ремня).

А двигатель то какой (модель)? 

Если компрессия ноль и метки ГРМ в норме, то могло погнуть клапана. Перепроверьте метки ГРМ и шпонки шкивов (верно ли шкивы стоят).